MTs Negeri 1 Alor, yang terletak di Jl. Banteng No. 1, Kalabahi Timur, Kecamatan Teluk Mutiara, Kabupaten Alor, Nusa Tenggara Timur, memiliki sejarah panjang dalam dunia pendidikan di wilayah tersebut. Madrasah ini awalnya didirikan pada tahun 1978 dengan status swasta dan berlokasi di Jl. Imam Bonjol No. 5, Kelurahan Binongko. Pada tahun 1993, melalui Surat Keputusan Menteri Agama Nomor 244 Tahun 1993 tertanggal 25 Oktober 1993, madrasah ini resmi berstatus negeri dan dikenal sebagai MTs Negeri 1 Alor.

Seiring berjalannya waktu, MTs Negeri 1 Alor terus berkembang dan meningkatkan kualitas pendidikannya. Pada 5 November 2011, madrasah ini berhasil meraih akreditasi A berdasarkan SK Akreditasi Nomor 65/BAP-S/M NTT/XI/2011.

MTs Negeri 1 Alor memiliki komitmen kuat dalam mengembangkan potensi siswa, baik di bidang akademik maupun non-akademik. Salah satu buktinya adalah penyelenggaraan Gebyar Olahraga dan Seni yang bertujuan untuk mengeksplorasi minat dan bakat siswa.

Dengan dedikasi yang tinggi dan upaya berkelanjutan dalam meningkatkan mutu pendidikan, MTs Negeri 1 Alor telah menjadi salah satu lembaga pendidikan terkemuka di Kabupaten Alor, berperan penting dalam mencetak generasi muda yang berakhlak mulia dan berprestasi.